先日ダウンロードした配列データがARBのデータであったので、何とかしてARBに読み込ませてFASTAに戻したい。というので一計を案じiTunesでBGMを鳴らしている基幹CF-W4のcoMomonga3を立ち上げ、momonga linux上でArbのサイトを訪問して最新のバイナリをとってくる。ARB_noOPENGLの方をインストールしなければならないという点にハマるが、なんとか解決。ついで、自然誌のSupplementary Informationからたどってデータファイルをダウンロード。ARBに読み込ませて、exportすると、ファイルサイズが250 MBほどになる。。これでは、Gmailでデータを転送するわけにいかず。USBフラッシュディスクに保存して、WinXPに戻ってくる。
ところが、そのままBioEditに読ませようとすると、見たことのないデータ形式ですと言って受け付けてくれない。xyzzyで行末の改行コードを変えてみたりするがはかばかしくない。仮想化技術に救われたつもりであったのに、最後に足許をすくわれた感じ。などと言っていては先に進めないので、compaqの方に移し、xyzzyでがしがし文字列置換を行う。メモリ不足のレポートが出たりするので、ページファイル、CPU使用率の監視中なり。CPU 100%使用中はまあ当然として、PFが潮が満ちるように制限値2 GBに少しずつ少しずつ接近するのは、恐怖感倍増である。[Linux]
