DECのワークステーションPW 500aで遺伝子解析パッケージが動き始めました。ばんざーい！
今日はグチを書きます。Red Hatの公式サポートページ参照ですが，Red Hat Linux/Alpha 5.1は，かなりprematureで，インストールできてもX-Windowはコンパイルミスで起動しないし，manが壊れていてオンラインマニュアルも読めないし，ネットワーク接続は不安定で修正プログラムのダウンロードさえままならない。要するにバグだらけのパッケージをインストールさせられてしまうわけですよ。これにはほとほとまいりました。まあ，Linuxってもともとそんなものと言えばそうですが，Intel入ってる用のTurboLinux2.0なんて，Win97相当ですよ（97は2097年の97です）。それでも，今PW 500aをふつうに使うなら，Red Hat Linux/Alpha 5.1を入れるより，WinTのままのほうがまだましかもしれません。ただ，私にはCコンパイラに関して選択の余地はなかった（10数万もするMS Cコンパイラ for Win NTを買うお金が無い…）ので，保証が受けられなくなりそうなアブナイことやってしのぎました。DECのAlphaマシンは，CPUこそintel x86系と全く違いますが，それ以外の基本部分はPC AT互換機なんですよ。だから，
Linux/intelで使えるPCI/ISAカードはLinux/Alphaでも使える
というわけです。これは，MacやSPARCStationにはないメリットですね。特殊な仕様じゃないからどこでも手に入り，安い。結局，Linux/Alphaではドライバのバグでうまく動かない本体付属のネットワークカードを殺し，九州デジコムさんに融通してもらったLANカード(EtherExpress Pro 10/100)を入れて，まずはネットワークに接続。何かのデーモンが定期的にエラーメッセージを吐いているけど，ftpはできる。サポートページからダウンロード(ftp)してきたパッケージでバグフィクス。これで，一応安定に動くようになりました（Xはまだ動かないけど…まあ，いいや）。
そこで，最新版のCコンパイラ(egcs)で，遺伝子解析パッケージをギンギンに最適化コンパイルし，昨日明け方４時から走らせてますが，Pentium 150の６〜８倍は早い！計算が終わるのは一週間後の予定なんですけど，それでもみんなで「すげー早いー」と喜んでいるわけです。二ヶ月を一週間に縮めるための40万なら，まあペイしてますよね。
