ここが従来うまく取り回せなかったところである。アラインメントをかけた配列は、もとの配列と比べるとギャップが入っているわけであるが、どこにギャップが必要かという計算に（いわば）1か月かけているわけなので、これが後々見比べられるように整理してお…

実に4週間かかって、ClustalX 2.0.5 on Win XP / Core2 6300 @ 1.86 GHzによるアラインメントが終了した。所要時間およそ242万秒は、前回のClustalW 1.8.3 on Linux / Celeron 2.8 GBでのものよりも4割ほど遅い。クロック数の逆数比が1:1.5になっていること…