CPU使用率100%で稼働していたClustalXのデュオであるが、一昨日2200の方の総当たり計算が終わった後、エラーが出て異常終了、6600の方のみ計算が続いていたが、これも今朝見てみると自動的にWindows updateがかかった後再起動されてしまって、まったく計算結果の回収はできず。この数日間の計算はまったく何であったのか、という塩梅となる。
今度は、シーケンスをまとめて、Bioeditの「塩基配列」→「該当する塩基（以外）を含む配列を消去」→「ACGT以外」を指定→でumbiguousな塩基対を含む配列に天誅を下して、残った10400本をBioeditビルトインのclustalWに流してみる。こういうのは、実際にやってみないと不具合が出てこないので面倒である。
まずこれらの10400本をアセンブラにかけて、完全に一致する配列を共有する部分配列をまとめてしまうと本数が飛躍的に少なくできそうな予感あり。[メタゲ]
