昨晩は、コマンドを打ってから答えが返ってくるのに15分ほどかかるのを数回繰り返して早朝になってしまった。寝不足で出勤し、営業部詰めの合間に、awkの一行野郎様でファイルの構造の調査を続ける。 サンプルは１被験者あたり18か所くらいからとっているの…

帰宅して夕食をとりながらUSBハードディスクをMacbook Airにつないで、データをコピー。こちらは15分ほどで終了。ついで、X11コンソールを開いて $ awk 'END {print NR}' SRP002395-7514-cs-nbp-rc.fsa と入力。カーソルは改行したまま。awkの中をすべてのキ…

それで、6月14日の自然誌の記載を参考に、HMPのホームページからたどっていってパイロシーケンスされたおよそ7200万本分の塩基配列の詰まったファイルをダウンロードするのであるが、これがbzipで圧縮かけて2.7 GBである。遠慮してftpプロトコールでダウンロ…

夏休み前のアサインメントの日程をほぼ消化したところで、来々月の米国本土出張のアサインメントが降ってわいた。ただし、7月20日までに演目を形にしなければならないという、厳しい制約が課される。 CEOからは、何かとものいりの時期ゆえ、旅費がすべてカバ…

ゼロハリバートンを宿舎にあずかってもらって会場へ。 いろいろと難しい問題があって、その原因の一つがリファレンスのゲノムデータの欠落部分であることをうかがう。

昨晩のフライトで羽田に到着。今朝は新宿ニューシティホテルで目覚め、大江戸線、半蔵門線を乗り継いで水天宮前駅へ。 レセプションで渡されたのが、このスローガン入りの携帯ストラップである。バイオインフォマティクスこそ「漢（おとこと発音する）のサイ…